Komory MSC (potocznie: komory biohazard) - przede wszystkim komory II klasy bezpieczeństwa - są przeznaczone do pracy z materiałem niebezpiecznym i zapewniają pełną ochronę personelu, otoczenia i produktu. Dwa/trzy zestawy filtrów HEPA klasy H-14 o sprawności 99,999% dla cząstek o średnicy >0,3µm oczyszczają zarówno powietrze, które trafia do komory roboczej, jak i powietrze, które wydostaje się z komory do otoczenia. W modelach do pracy z substancjami, nie ulegającymi biodekontaminacji (np. cytostatyki), instalowany jest dodatkowy zestaw filtrów, które umożliwiają bezpieczne serwisowanie i wymianę filtrów podczas pracy komory.
Uwaga! komora laminarna uznawana za komorę bezpieczeństwa MSC powinna posiadać certyfikat zgodności z normą PL-EN 12469-2000 wystawiony przez niezależną, powszechnie uznaną organizację (np. TÜV).